Ну, например, у нас Аэрофлот требовал пермит при регистрации в спб

Когда и на каком этапе?

15 апреля

Этого года?
Проблемы с Аэрофлотом кончились примерно с ноября. Если требуют сейчас, это не от большого ума.
Тут варианта два.
1. Пересылаете Аэрофлоту официальный ответ ветконтроля и настаиваете на том, что сотни людей еженедельно летают без пермита. И авиакомпания не может этого не знать.
2. Требуете у авиакомпании официальный запрос н пермит и долбите ветконтроль Бангкока.
Можно действовать в обоих направлениях сразу.
В целом же, судя по отзывам в интернете, такие проблемы единичны.