Зависит от того, на сколько больше Ваше "больше". Небольшие излишки можно оплатить наличными (но сумма сделки в нотариальном договоре не может быть ниже кадастра), можно arras (предконтракт) сделать не на обычные 2-3 тыс, а на 20-30 тыс.
Вам, в любом случае, стоит это обсудить с нотариусом, который будет сделку проводить. При отсутствии счета в ЕС, полагаю, платежи придётся делать через него.