у меня такое было, когда я продала недвижимость, в которой была зарегистрирована. при снятии с регистрации автоматически снимают с учета в налоговой. причем регистрация у меня там осталась, но им было достаточно того, что я больше не владею объектом для снятия с учета в налоговой меня как физлица