Нет, в шенген вам точно никто запретить по такой причине въезжать не может, не беспокойтесь
Если вы всё правильно и «чисто» собрали и уложились в сроки, одобрили бы. По учёбе, насколько мне известно, отказов мало. Давайте подумаем, что могло пойти не так? Есть какие-то предположения у вас?