Евро6 это ограничение на обычную растаможку машин извне еврозоны. Для льготной такого ограничения нет, это ваше имущество и вы вправе зарегистрировать его в Испании на льготных условиях.
Ну а про прохождении itv будут проверять соответствие выбросов классу вашей машины, а не евро6.