В нормальных эстранхериях смотрят только на штампы шенгена, и если спрашивают допом хоть что-то, то только если человек сам заявил превышение сроков. Разные бывают обстоятельства, почему человек долго отсуствовал, и это не всегда отказ.
Если подать второй/новый паспорт без штампов, то (опять же - "в нормальной эстранхерии") примут и не будут цепляться, так как ценз оседлости по сути условно-контролируемая формальность, а старый паспорт человек уже подавал.
Можно вообще не жить все 5 лет в испании, находиться в другой стране ЕС и никто об этом никогда не узнает.
Совсем другое дело, если применить "презумпцию вины недобросовестного заявителя".
Тут простор фантазии - выехал через Латвию в РФ? А когда ты туда попал, за 8 мес до этого, не иначе. Посадочные ок, но это не серьёзный документ. Вот было бы у тебя какое нибудь нотариальное действие в те дни, когда ты говоришь что был в испании.. ах нету? Ну посадочные мы не можем принять.. паспорт потерял? Ах так.. ну давай справку из рф полиции с присяжным переводом. Хорошо бы копию старого паспорта, заверенную нотариусом испанским, и чтобы дата была накануне утери (иначе все дни посчитаем, как будто от нотариуса ты сразу в аэропорт уехал, мы же не знаем где ты был..), мы должны убедиться, что ты не обманываешь.. и т.д.
Вахтеризм явление интернациональное)