Тогда да, старый аннулируют. Но он у Вас останется на руках. Думаю, что консульство пойдет тут на встречу. Берите оба на подачу. И подайтесь на биосетрический. Я бы ещё написала в консульство вопрос и заручилась их одобрением.
У меня вообще украли паспорт. Я написала в консульство СПб и описала им ситуацию, выслала скан украденного. Меня записали на дату когда у меня уже будет паспорт на руках. Но сказали, что в матрикуле должны быть данные нового паспорта.