На внутренних рейсах шенгена нет паспортного контроля. Правда были случаи, что польская компания LOT якобы русских не пускала на борт, но это может быть просто человек такой попался.
Я в Польшу летал из Италии через онлайн регистрацию и мобильный посадочный билет. На гейте просканировали код и первую страницу паспорта посмотрели и все. Если чекинится в аэропорту, могут наверно и посмотреть