Рассказывал кто-то, что венгры, выдавая визу, предупреждали не ездить по ней в ряд стран - Польша, Чехия, Эстония, Латвия (может еще кто-то не помню), т.к. есть вероятность аннуляции. Т.е. скорее всего это разовые случаи, но венгры рекомендуют перестраховаться.
Предполагаю тут имеется ввиду, чтобы не въезжать в эти страны из внешних границ шенгена, если ты въезжаешь через внутренние, отлавливать и аннулировать визы никто не будет. У меня у самого маршрут Австрия-Польша-Венгрия, австрийцы приняли без вопросов.