Пока да. Выходить придется в деревне Кяна, это полчаса на такси до Вильнюса.
Но рекомендую перед выездом глянуть форумы, в правительстве Литвы готовятся "принять системное решение" по возможности россиян выходить на технической остановке на станции Кяна. И вряд ли это решение будет на пользу этому варианту пробираться в ЕС.
UPD. С туршенгеном да, нельзя, нужен ВНЖ страны ЕС или второй паспорт, Израиля хотя бы.