это придется сделать, так как в анкете на МВВ будет вопрос, были ли МВВ до этого. Вряд ли в IND посчитают Вас другим человеком с новым паспортом. Скорее зависнут и будут дозапрашивать документы.
Лучше всего написать им или позвонить напрямую и спросить, что и как делать в данном случае, и какие доки и подтверждения приложить сразу.
Плюс, БСН и v-number присваиваются 1 раз и навсегда, и их надо привести в соответствие с новой Вашей реальностью 🙂