Добрый день, подскажите, сколько примерно по времени занимает получение одобрения IND для зарегистрированного партнёра? Подтверждение на себя получил, правильно ли я понимаю, что подаваться на MVV лучше вместе?

Подтверждение на вас какое?
Если вас с партнером работодатель подавал, то решение от IND в 99% случаев принимают одновременно на всю семью.
Если только по вам, то до получения партнёром MVV нужно на него подать запрос.
Если его подает работодатель, то обычно рассматривают быстро (2-3 недели), если вы сами, то 1,5-3 мес.

Подтверждение называется IND confiramtion of reference. Судя по тому, что работодатель только сейчас запросил паспорт партнёра, а также заполнить sponsorship declaration и Antecedents, то он только будет запускать этот процесс.

Тогда, да, придётся подождать.