удивительно, почему им самой визы не хватает(

Ну мало ли. Граница всё таки. Возможно зависит от офицера, но нидерладцы по моему небольшому опыту любители дружелюбно поболтать. Может ему хочется лишнюю минутку пообщаться)

Я знаю что в штатах виза - это необходимое условие, но не гарантия пропуска в страну. Решение принимается всегда пограничником на паспортном контроле. Возможно тут тоже такой принцип есть, но это мои догадки.

это для любой страны верно. даже когда безвиз вас могут не пустить по многим причинам, даже субъективным
самое сложное это не паниковать и знать кому позвонить. В вашем случае при такой ситуации лучше знать телефон релокейт менеджера вашей компании, который сможет подтвердить что они правда обязуются взять вас на работу.
ну и дружелюбно

Ну судя по приложению к визе в виде справки, так и есть
Там так и написано, что виза сама по себе не является гарантией, что вам пустят в шенгенскую зону