"В случае если перед посещением Японии планируется въезд в третью страну с выходом из транзитной зоны, при выезде из этой третьей страны не ранее чем за 72 часа необходимо будет сдать тест на COVID-19."
если 72 часа не прошло от момента сдачи теста до момента вылета в япоху, то повторно тест сдавать не нужно выход из транзитной зоны сам по себе не заставляет сдавать тест повторно
Можете пересдавать сколько хотите, но в заблуждение других вводить не нужно. То что на сайте посольства написано, можно интерпретировать двояко. В документе описан контекст