Транзит оформляют в аэропорту. При этом строго важно, чтобы аэропорт (страна) из которого вы летите и в который потом летите были разные и пишут логично для пересадки ( то есть типа Токио - Сингапур - Осака не пройдёт) Перед вылетом нужно заполнить электронную форму. Транзит до 96 часов. Время считается с момента реального приземления самолета. В транзитной визе время не ставится, но 100% учитывается в системе.