А есть ли смысл метаться, если через неделю мне должны были выдать новую в связи с пролонгацией визы?

тебе новую не дадут без старой

по закону ты должен с зайрю ходить, если попросят предъявить и ты не сможешь, то будет штраф

Да, это я знаю. Однако в случае утери, как я понял с сайта вы обязаны заявить об утере в течении 14 дней с момента обнаружения утери. Получается юридическая коллизия.
Читал тут https://www.moj.go.jp/isa/applications/procedures/nyuukokukanri10_00010.html

Ну итоговый вывод такой: иду в большую полицию, пишу заявление об утере, с ним иду в миграционку делать новую зайрюху. Нужно ли уведомлять мобильного оператора о смене номера карты. Кого ещё надо уведомить? Например у меня машина в собственности, там что то нужно менять?