В Япония хорошая транспортная сеть. В аэропорт дорога у вас случится 2 раза максимум. И по городу вы будете перемещаться во всех направлениях, так как нет такого, чтобы все в одном месте. Обратите внимание, что в Токио при пересадки с частной на муниципалтные ветки нужно доплатить. От маршрута и выбираете расположение отеля, с минимальными пересадками. Отели и 3 звезды есть очень приличные, просто номера в них маленькие. А чистота везде на высоте.