Гугл смотрит на то, что сейчас время позднее уже? А то тут по 6-7 часов варианты

Там можно указать время, как и в любом другом планировщике. Это надо всегда учитывать.

в гугле тоже можно указывать время, карты нормально все планируют

Именно в планировании у гугла для меня есть минусы:
1. Он не показывает стоимость плечь (отрезков), только общую
2. Нет отметок о стоимости/необходимости reserved seat (ну и разбивки цены по reserved/fare)
3. Нельзя посмотреть расписание (актуально для редкого транспорта)
4. Для длинных маршрутов выдача менее информативная (сравните скриншоты по бессмысленному маршруту Ueno -> Himeji)

p.s. попробовал navitime, не зашёл, хотя тоже не плох

Это не мои, если что. Вы точно мне отвечаете?)

Извиняюсь, перепутал 😔️️️️️️