И мой опыт общения с японцами показал, что у многих предвзятое отношение к мусульманам, да и в целом к любой религии.... Увы

они - атеисты? или у японцев непредвзятое отношение только к буддистам японского толка?

Синтоизм и буддизм в Японии это не просто религия, это уже как часть культуры, это не просто раз в год сходить в церковь свечку поставить. Тут всё гармонично вплетено в повседневный быт, но в некотором роде из даже можно назвать атеистами или язычниками, в нашем понимании.
Говоря проще, религия одного бога который якобы создал всё это бред собачий, примерно в таком контексте проходили мои диалоги на тему религии в Японии с японцами, утрированно, но коротко передал суть.

Спасибо за пояснение!
Любопытно будет поглядеть, как они сплели атеизм с синтоизмом+буддизмом и частью культуры.