Подавалась на визу lavoro autonomo. Придрались по всем пунктам. Расцениваю это как человеческий фактор. Боюсь, что из-за этого штампа могут быть проблемы в Московском. Не знаю, как поступить, не показывать штамп и старый паспорт?
Если действительно все как вы написали, то ваш единственный путь апелляция в суд. Они все видят, они знают что у вас другой паспорт и в нем отказ. И сейчас пытаться обмануть их - высок шанс получить бан без возможности обжаловать.