С просрочкой визы вроде могут выпустить. Но могут задержать для выяснения обстоятельств. Или потребовать лететь в страну гражданства. Или хоть показать доки в страну гражданства через транзитную страну.
Вам лучше это выяснять у погранслужбы заранее.
Но точно дадут запрет на въезд в шенген и визу потом не получите долго еще.