Как уже выше написали, супруге придётся строить маршрут через Турцию: рейс в Москву (Шереметьево), пройти там паспортный контроль и полететь в Калининград. Крюк нормальный получится, конечно. Запасной вариант на рассмотрение: полететь в Вильнюс, оттуда автобусом в Минск, а из Минска в Москву