Смотрите на сайте sncf расписания. В целом в Лионе рейсов со станции в аэропорту почти нет. Скорее всего придется выбираться в город на центральную жд станцию.
На всякий случай: если поедете автобусом, надо приехать заранее, чтобы не потеряться. Там две "стороны" у вокзала: стороны Saône и сторона Rhône, на парковке нарисовано R1, R2 и тд.