Скажите пожалуйста

Возникнут ли проблемы с фамилией ребенка

если у нас с женой в паспортах фамилия пишется через разные буквы

у нее nadaraia
а у меня nadaraya

В чем именно проблема? У меня с мужем все буквы в фамилиях разные 😁. Ребенку присваивают либо фамилию мамы, либо отца, соответственно будет или, как у Вас или, как у жены.

Да мало ли😁бюрократия штука дурная )

Успокоили ) спасибо

Вам предложат написание фамилии ребёнка как в паспорте отца + добавление буквы "а", если родилась девочка. Если родился мальчик, то скажут как в паспорте отца. Вам нужно посмотреть, чей загранпаспорт был оформлен по международным стандартам транслитерации. Если у жены правильно, то попросите оформить ребёнка на фамилию жены

Только потом, если Вы поменяете паспорт, и там будет другая транслитерация - может выйти неловкость (за достоверность не ручаюсь, но мне так говорили).
Теоретически решается доплистом исправлений.
На практике не скажу, увы 🤷🏼‍♀️